To Τμήμα διαθέτει πέντε θεσμοθετημένα εργαστήρα: Υδροβιολογίας – Ιχθυολογίας (εΥΙ), Ωκεανογραφίας Υδατοκαλλιέργειας, Εμπορίας & Τεχνολογίας, Αλιευτικών Προϊόντων και Τροφίμων, Οικοϋδραυλικής & Διαχείρισης Εσωτερικών Υδάτων Εγχειρίδιο Ασφαλείας Εργαστηριακών Χώρων